茭白虽然是无性繁殖作物，但由于茭白黑粉菌寄生后而形成肉质茎，茭白自身或黑粉菌任何一方发生变异都会引起茭白植物学性状的变异，与其它无性繁殖的作物相比其变异大得多。留种用种株须年年选种，方可保持茭白的种性和纯度。国内许多省区引种双季茭后而不能成功，主要是选种这一关键措施被忽略。

   选种的标准是：①植株的长势长相及分蘖性与原品种一致，也就是与田间大多数植株一致。②茭墩内无一株灰茭或雄茭，若有，则该墩茭白不宜留种。③肉质茎的主要特征与原品种一致。④茭墩内多数分蘖生长整齐，孕茭期和采收期也比较集中。⑤苔管相对较低，因品种而定。在田间选种须随时作好标记或绘图记下各墩所在的株行位置，待秋茭采收完毕后移入留种田。